更新時(shí)間：2022-06-12
illumina二代測(cè)序儀MiSeq系統(tǒng)可通過(guò)各種測(cè)序應(yīng)用為您的研究提供便利。它能夠自動(dòng)生成雙端read，每次運(yùn)行的產(chǎn)出高達(dá)15 Gb，每條read可提供600多個(gè)堿基的測(cè)序數(shù)據(jù)。它使用的文庫(kù)制備試劑盒已針對(duì)多種應(yīng)用進(jìn)行了優(yōu)化，包括靶向基因測(cè)序、小型基因組測(cè)序、擴(kuò)增子測(cè)序、16S宏基因組學(xué)等。
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Illumina公司推出的MiSeq是一臺(tái)在單個(gè)儀器上整合了擴(kuò)增、測(cè)序和數(shù)據(jù)分析的新款測(cè)序儀，每次運(yùn)行能產(chǎn)生超過(guò)1Gb的數(shù)據(jù)，且占地面積僅為2平方英尺。MiSeq的流程和準(zhǔn)確性，讓它成為快速且經(jīng)濟(jì)的遺傳分析的理想平臺(tái)，適合廣泛的應(yīng)用。同時(shí)Illumina已被FDA大量采購(gòu)并即將通過(guò)FDA認(rèn)證，12年10月，MiSeq系統(tǒng)的測(cè)序通量已升級(jí)至8G左右。升級(jí)通過(guò)兩個(gè)方面完成，一個(gè)是cluster密度的增大，升級(jí)后cluster密度增加至15-17million，而pair-end讀取的reads數(shù)目將會(huì)增加至30-34million；另一方面是通過(guò)測(cè)序讀長(zhǎng)而提升通量，測(cè)序讀長(zhǎng)達(dá)到2*300bp，同時(shí)測(cè)序速度也有所提升。目前，Broad研究院已經(jīng)利用現(xiàn)有試劑實(shí)現(xiàn)了單端測(cè)序300bp讀長(zhǎng)，Illumina目前內(nèi)部測(cè)序更是完成了2*400bp的pair-end測(cè)序。而這些，都是保證在高質(zhì)量數(shù)據(jù)結(jié)果的前提下完成的。
Illumina MiSeq測(cè)序時(shí)間和數(shù)據(jù)量
| 讀長(zhǎng)（bp） | 時(shí)間 | 總數(shù)據(jù)量 | Q30 |
| 1×36 | ～4 hrs | 540-610 Mb | ﹥90% |
| 2×25 | ～5.5 hrs | 750-850 Mb | ﹥90% |
| 2×100 | ～16.5 hrs | 3.0-3.4 Gb | ﹥85% |
| 2×150 | ～24 hrs | 4.5-5.1 Gb | ﹥80% |
| 2×250 | ～39 hrs | 7.5-8.5 Gb | ﹥70% |
Illumina MiSeq讀取量比對(duì)
| 運(yùn)行類(lèi)型 | 通過(guò)過(guò)濾的讀?。ò偃f(wàn)） | |
| 升級(jí)前 | 升級(jí)后 | |
| 單端讀取 | 5-7 M | 15-17 M |
| 末端配對(duì)讀取 | 10-14 M | 30-34 M |
illumina二代測(cè)序儀 MiSeq四大特性
1、較短的實(shí)驗(yàn)周期：從樣品制備開(kāi)始需要8小時(shí)即可得到超過(guò)100M的高質(zhì)量測(cè)序結(jié)果。
2、便捷的樣品制備流程：需50ngDNA模板，2小時(shí)的自動(dòng)化操作就可以完成全部樣品制備工作。
3、測(cè)序原理：MiSeq繼續(xù)GA和HiSeq平臺(tái)的邊合成邊測(cè)序的化學(xué)原理。
4、完整的整合功能：MiSeq可以獨(dú)立完成簇生成，雙向測(cè)序及數(shù)據(jù)分析工作，讓經(jīng)費(fèi)和實(shí)驗(yàn)室空間不再成為NGS研究的障礙。
illumina二代測(cè)序儀 MiSeq應(yīng)用范圍
1、轉(zhuǎn)錄組測(cè)序
派森諾MiSeq測(cè)序平臺(tái)是基因組已測(cè)序物種的轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)。公司技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了包括斑馬魚(yú)在內(nèi)的多種植物、動(dòng)物的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序及分析。
2、宏基因組16S rDNA單V區(qū)測(cè)序
對(duì)16s rDNA的單V區(qū)(V3\V4)進(jìn)行高通量測(cè)序，鑒定細(xì)菌群和古生菌群。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)使用Illumina MiSeq測(cè)序16S rDNA V4區(qū)并結(jié)合Roche 454 FLX+測(cè)序16S rDNA V1~V3區(qū)成功的對(duì)雞的腸道環(huán)境細(xì)菌進(jìn)行了鑒定。
3、Small RNA測(cè)序
1*35bp的讀長(zhǎng)配合了小RNA的測(cè)序長(zhǎng)度，速度快，靈敏度高。派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)目前已完成了鵝的小RNA測(cè)序和多種中草藥的小RNA測(cè)序。
4、重測(cè)序：包括全基因組重測(cè)序、簡(jiǎn)化基因組測(cè)序、外顯子測(cè)序。
Illumina MiSeq非常適用于對(duì)微生物基因組的重測(cè)序，每次運(yùn)行即可完成一個(gè)微生物基因組測(cè)序。2011年12月27日，派森諾的技術(shù)團(tuán)隊(duì)利用MiSeq一次運(yùn)行同時(shí)完成了乳酸菌（Lactobacillus casei Zhang和Lactobacillus casei P8）的重測(cè)序，基因組覆蓋深度為分別為404倍和213倍，比對(duì)至參考序列，基因組實(shí)現(xiàn)全覆蓋，同時(shí)檢測(cè)到了多種結(jié)構(gòu)變異，包括插入、缺失和SNP位點(diǎn)，并且檢測(cè)到了全部質(zhì)粒。
* 以上產(chǎn)品介紹及數(shù)據(jù)來(lái)源于Illumina，僅供參考，以Illumina為準(zhǔn)。
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